治療小兒尿路感染，最主要的是選擇有效的抗生素，其最終目的不外乎是爲了提高治癒率，減少複發率，並能以最小的副作用取得最滿意的效果。
1、首先是選用對致病菌敏感的抗生素。根據體外藥敏試驗結果指導臨牀治療，仍不失爲行之有效的辦法，據報道其與臨牀療效的符合率爲70-80%。但值得一提的是:由於藥物在腎組織內分佈濃度的不同，以及藥物在不同的病人發揮作用的內環境不同，因此，臨牀療效與藥敏結果有時並不完全符合。這是我們必須加以注意的。
2、合理選擇抗生素及其療程，臨牀應根據尿路感染的定位，症狀的輕重以及有無合併尿路畸形等綜合分析。由於急性膀胱炎爲粘膜淺層的感染，尤其是初發的病例，臨牀應儘可能選用尿中濃度高的抗生素，通常可採用短程療法，但需要指出的是:鑑於小兒尿感定位困難，尤其是小嬰兒，現許多學者仍主張採用10-14天的常規療法。至於腎實質的深部感染，現多數主張採用血和尿濃度都比較高的藥物，並儘可能選用抗菌作用強的殺菌劑。如果是複雜性尿感所致的腎實質感染，還需考慮到耐藥菌株的存在，則常常推薦聯合用藥，同時應選用靜脈注射以及適當延長療程的辦法。一旦症狀控制後，還需長期給於維持量的治療和隨訪。
3、儘可能選擇腎毒性小或副作用少的抗生素以避免造成腎實質的損傷。由於小孩，尤其是小嬰兒，其腎功能尚不健全，對機體內水電介質以及毒物排泄的調節功能校差，因此，抗生素的選擇既要強調它的有效性也要考慮到它的負面影響
綜上所述：對於小孩的尿路感染，臨牀應根據初發或復發的不同，上下尿路感染定位的不同以及是否合併複雜性尿感的不同，合理用藥，區別對待。
