同屬亞洲的鄰國關係。
新加坡曾作爲聯邦省加入馬來西亞，後因各方面的原因而獨立出來。新加坡在19世紀初淪爲英國殖民地，在1963年9月脫離英國的統治正式加入馬來西亞。由於各方面因素，馬來西亞國會於1965年8月9日將新加坡驅逐出聯邦。隔日新加坡獨立建國。
1965年8月9日，新加坡脫離馬來西亞，成爲一個有主權、民主和獨立的國家。同年12月22日，新加坡成爲共和國，尤索夫·賓·伊薩克出任首任總統。
新加坡北隔柔佛海峽與馬來西亞爲鄰，南隔新加坡海峽與印度尼西亞相望，毗鄰馬六甲海峽南口，國土除新加坡島(佔全國面積的88.5%)之外，還包括周圍63個小島。
馬來西亞和新加坡在上世紀本是一家人，自從新加坡從馬來西亞獨立出來以後，在涉及領土主權、生活生產，以及經濟利益等方面矛盾逐漸顯現，甚至使兩國陷入關係惡化的局面。
現在的新加坡是東南亞地區的一個島國，面積僅有719平方公里，還不如我國一些縣的面積大，新加坡離鄰國最近的就馬來西亞，中間就隔着一條1.4公里長的柔佛海峽。
本來在歷史上，新加坡並不是個獨立的國家，早在18世紀19世紀時，新加坡就是馬來西亞的一部分，那時候的馬來西亞領土中有一個叫柔佛王國，新加坡就是柔佛王國的轄地。
所以新加坡和馬來西亞也算是“本是同根生”的兄弟了，同在一個屋檐下，兩地的人員往來和經商貿易也是非常的密切。此後大英帝國的殖民統治延伸到此地，新加坡被英國“擄走”。然而，二戰的來臨，新加坡的命運再遭改變。
二戰期間，新加坡被日本帝國主義軍隊佔領，在日本投降後，雖然英國恢復了對新加坡的殖民統治，但是沒多久，隨着全世界民族解放運動興起，新加坡也於1959年6月實行內部自治，成爲自治邦。
由於當時全球貿易往來和服務業並不像如今這麼發達，獨守孤島的新加坡生存面臨窘境，作爲當時新加坡的當家人李光耀不得不提出希望與馬來亞共同組建國家，是曰“馬來西亞”。果然這個計劃獲得通過，新加坡再次找到歸宿。
令李光耀意料不及的是，新加坡“迴歸”馬來西亞，並未給新加坡帶來重大福利，反而惹了一身騷。由於新加坡島絕大部分人是華人華裔，與馬來亞人的衝突矛盾急劇升溫。馬來亞人作爲馬來西亞國家的主體族羣，自然會處處給馬來人自己謀福利，令新加坡華人華裔備感悲憤。
另一方面，新加坡島還有一個強大的鄰居，就是當今世界最大的羣島國家，也是穆斯林人口最多的國家印度尼西亞，印尼的.小算盤當時打的夠精的，不願意身邊出現一個強大的鄰居，就果斷切斷與鄰國的關係，人員往來停滯，很會做生意的新加坡華人商人由此損失慘重。
李光耀當初想的是依靠馬來西亞這棵大樹，能好乘涼。可新加坡從1963年9月16日正式併入馬來西亞，到1965年8月9日正式宣告脫離馬來西亞成立一個獨立的共和國，這短短兩年的時間，可把新加坡害苦了。
事實證明了，把自己的發展寄希望於別人，到頭來等到的永遠都是啞巴虧，有苦還說不出。
新加坡從馬來西亞獨立後，兩者作爲獨立國家，瞬間從一個屋檐下的一家人，開始成爲吃兩家飯的鄰居。也是從這一刻開始，由於主權國家所引起的領土主權歸屬、利益分割、生產生活等問題也接踵而來，至今新加坡和馬來西亞仍有三大主要問題，成爲阻礙兩國關係的絆腳石。
新加坡對馬來西亞供水價格擡高問題
新加坡雖然是個島國，但是淡水資源極度匱乏，甚至不得不向鄰國馬來西亞的柔佛州買水喝。在1962年，新加坡還是英國殖民地，並未與馬來西亞合併之時，兩者就關於向新加坡供水問題達成協議。
當時規定馬來西亞柔佛州每天向新加坡供水3.25億升淡水（32.5萬立方米），每1000加侖（相當於4546升）水只收0.03林吉特（相當於5分人民幣），也就是說每年新加坡向馬來西亞提供水費僅有3574元人民幣左右。
這項協議持續到2011年，失效後，新加坡和馬來西亞又續簽了協議，有效期從2011年到2061年，這份協議中，新加坡向馬來西亞買的水量大幅提升，達到9.46億升淡水，但是水價還是原價沒變。
長期低廉的水價，引起新上任的馬哈蒂爾首相的不滿，在2018年6月26日，馬來西亞總理馬哈蒂爾接受新加坡媒體時表示：
馬來西亞有重新考慮與新加坡之間供水協議的計劃，希望提升供水價格。馬哈蒂爾直言水價太低，擱現在什麼都買不到。確實3000元人民幣左右的水價養活新加坡一半人口，確實太低了。
而新加坡也不滿馬來西亞的提議，認爲既已達成協議，便不可違背協議，兩國的供水矛盾便由此產生。馬來西亞軍隊高級軍官曾表示：如果馬新供水問題無法妥善處理，有可能引發兩國的軍事衝突。
新加坡對馬來西亞單方面填海造地問題嚴重不滿
此前，馬來西亞修建馬六甲皇京港，已經惹得新加坡方面嚴重不滿，認爲馬來西亞此舉意在和新加坡搶生意，削弱新加坡作爲國際貿易中轉站的地位。現在，馬來西亞又要在柔佛州擴建巴魯港。
馬來西亞的巴魯港與新加坡隔海相望，是馬來半島南部的重要港口之一，2018年10月份正式提出要擴建，由於柔佛州的.巴魯港可能與新加坡有海堤相連，馬來西亞一旦擴建，必然會壓縮新加坡在該地的權益，隨即新加坡對馬來西亞的馬哈蒂爾政府提出抗議。
馬來西亞的填海造地問題，在某種程度上說也是涉及到新加坡的主權問題，還是比較嚴重的。
新加坡與馬來西亞圍繞南海白礁島主權爭奪問題
新加坡和馬來西亞爲了南海的白礁島還鬧上國際法庭，這個白礁島距離馬來西亞的柔佛州7.7海里，距離新加坡25.5海里，只有2000平方米大，是個無人居住的島礁。
白礁島最早的主權是馬來西亞柔佛州，但是由於英國殖民主佔領該地區後，就把白礁島交給新加坡管轄，而且從1847年至1979年，在這130年時間內，新加坡對白礁島的主權聲索已經是衆所周知
國際並未提任何異議。直到1979年，馬來西亞才突然在其所出版的新地圖中首次把白礁島劃入馬來西亞的領土範圍，開始與新加坡爭奪白礁島的主權。
